Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms