Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sgf29Q9DA08 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms