Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms