Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms