Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1Q9D883 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms