Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4cQ9D7F7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms