Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3bl1Q9D701 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3bl1Q9D701 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms