Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rtl8cQ9D6I0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rtl8cQ9D6I0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rtl8cQ9D6I0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rtl8cQ9D6I0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rtl8cQ9D6I0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl8cQ9D6I0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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