Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D454 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D454 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D454 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D454 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D454 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D454 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms