Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpn3Q9D3W4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpn3Q9D3W4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms