Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rufy3Q9D394 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms