Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snapc3Q9D2C9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snapc3Q9D2C9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snapc3Q9D2C9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snapc3Q9D2C9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snapc3Q9D2C9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snapc3Q9D2C9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snapc3Q9D2C9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms