Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms