Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyc1Q9D0M3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyc1Q9D0M3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms