Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms