Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms