Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp3Q9D032 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssbp3Q9D032 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp3Q9D032 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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