Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms