Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim13Q9CYB0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms