Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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