Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Xrcc2Q9CX47 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Xrcc2Q9CX47 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Xrcc2Q9CX47 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc2Q9CX47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Xrcc2Q9CX47 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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