Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pin4Q9CWW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms