Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms