Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raver1Q9CW46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver1Q9CW46 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms