Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ranbp3Q9CT10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ranbp3Q9CT10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms