Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms