Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5f1Q9CQQ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms