Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Chchd5Q9CQP3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms