Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms