Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms