Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms