Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ncbp2Q9CQ49 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ncbp2Q9CQ49 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms