Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms