Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms