Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2ird2Q99NI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms