Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms