Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc5Q99LG4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc5Q99LG4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc5Q99LG4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc5Q99LG4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc5Q99LG4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc5Q99LG4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms