Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RtcbQ99LF4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms