Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms