Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lims1Q99JW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms