Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms