Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Apobec3Q99J72 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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