Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms