Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms