Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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