Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm2Q91YD4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms