Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms