Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms