Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smg8Q8VE18 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Smg8Q8VE18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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