Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1aQ8VDS4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1aQ8VDS4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms